Molekulare Docking-Software-Tools sagen die Bindungsorientierungen und -affinitäten eines kleinen Moleküls innerhalb der Bindungsstelle eines Zielproteins voraus und erleichtern so die Identifizierung möglicher Wirkstoffkandidaten. Sie sagen voraus, wie kleine Moleküle, wie beispielsweise Substrate oder Wirkstoffkandidaten, in die Bindungsstelle eines Proteins passen würden, indem sie die Wechselwirkung zwischen Liganden und Proteinen simulieren. Diese Simulation unterstützt das Wirkstoffdesign und die biochemische Forschung, indem sie Einblicke in die Pharmakokinetik und Pharmakodynamik von Substanzen liefert.
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