Epigenetyka W Sercu Nowotworów

Rak to niekontrolowany rozrost nieprawid¿owych komórek; jest to jedna z chorób zwi¿zanych z zaburzeniami dziäania enzymów deacetylaz histonowych (HDAC).Skupili¿my si¿ na leczeniu nowotworów opartym na hamowaniu deacetylaz histonowych w ramach badä nad opracowaniem nowych inhibitorów enzymu deacetylazy histonowej 8 (HDAC8), który zostä wybrany jako cel biologiczny. Wykorzystuj¿c metody wirtualnego przesiewania i dokowania za pomoc¿ oprogramowania MVD6.0, zastosowäy¿my baz¿ danych PDB "5FCW" oraz struktury podobne do PCI34051 i NCC14, wybrane jako inhibitory referencyjne. Wyniki dokowania za pomoc¿ programu MVD däy warto¿¿ RMSD = 0,788 Å, a po przeprowadzeniu przesiewu wybrano 20 pozycji, które wykazuj¿ najlepsze oddziäywania z aminokwasami w miejscu aktywnym niezb¿dnym do dziäania. Aby zmniejszy¿ liczb¿ uzyskanych cz¿steczek, zastosowali¿my filtracj¿ zgodnie z regu¿¿ Lipi¿skiego, a po weryfikacji uzyskali¿my pi¿¿ oryginalnych cz¿steczek (137633786, 50898670, 59727889, 142365753, 145926745), które tworz¿ wi¿zania wodorowe z co najmniej jedn¿ z trzech reszt w miejscu aktywnym, co stanowi interesuj¿cy kierunek dalszych badä.